Florian Ebner a étudié la photographie à l’École nationale supérieure de la photographie d’Arles et l’histoire de l’art à l’université de la Ruhr à Bochum. Depuis fin 2012, il est directeur de la collection de photographie du musée Folkwang à Essen. De 2009 à 2012, il a été directeur du Museum für Photographie de Brunswick, et en 2008-2009 il était en charge de la collection photo de la Galerie berlinoise. Auparavant, il a enseigné la photographie à l’Académie des arts visuels de Leipzig. En 2015, il a été le commissaire du pavillon allemand de la 56e Biennale de Venise.